在PCR反应中 为什么科学家常合成20个左右碱基的核苷酸片段作为引物 而不用更多或更少碱基的核苷酸片
在PCR反应中,为什么科学家常合成20个左右碱基的核苷酸片段作为引物,而不用更多或更少碱基的核苷酸片段?
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参考解答
正确答案:×
经验表明,引物设计的正确与否是关系PCR扩增成败的关键因素。引物太短,就有可能同非靶序列杂交,得到非预期的扩增产物。例如在人类基因组中克隆基因,如果用8核苷酸引物,那么平均每隔48=65536个碱基就会有一个结合位点,在全长3×109个碱基的基因组中大约会有43000个可能的结合位点;而如果使用20个核苷酸的引物,它的预期频率是平均每隔420=1.1×1012个碱基才会有一个结合位点,远超出人类基因组长度,可以获得单一的扩增产物。但如果引物过长,那么引物同模板DNA的杂交速率下降,导致在反应循环周期内无法完成同模板的完全杂交,从而降低了PCR反应的杂交率。
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